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Le '''microbiote''' correspond à l'ensemble des micro-organismes présents à la surface du revêtement cutané.
Le '''microbiote''' correspond à l'ensemble des micro-organismes présents à la surface de la peau.
* Le corps humain est recouvert de très nombreux micro-organismes de façon naturelle. On considère que chaque cm² de peau humaine héberge 10<sup>6</sup>.
* Le corps humain est recouvert de très nombreux micro-organismes de façon naturelle. On considère que chaque cm² de peau humaine héberge 10<sup>6</sup>.
* Ces micro-organismes vivent en symbiose avec leur hôte humain et forme le microbiote cutané.
* Ces micro-organismes vivent en symbiose avec leur hôte humain et forme le microbiote cutané.<ref>Grice EA, Segre JA The skin microbiome. Nat Rev Micobiol 2011,9:244-53</ref><ref>Chen YE, Tsao H The skin microbiome: current perspectives and future challenges J Am Acad Dermatol ;-</ref>
==Flore bactérienne cutanée==
==Flore bactérienne cutanée==
* Les micro-organismes qui forment le microbiome cutané sont présents à la superficie de la peau, sur le ''Stratum corneum'', , sur la partie supérieure des follicules pileux et dans les conduits des glandes sébacées.
* Les micro-organismes qui forment le microbiome cutané sont présents à la superficie de la peau, sur le ''Stratum corneum'', , sur la partie supérieure des follicules pileux et dans les conduits des glandes sébacées.
* Les bactéries peuvent également coloniser des sites que l'on supposait stériles comme le derme ou l'hypoderme.<ref>Nakatsuji T et al. The microbiome extends to subepidermal compartments of normal skin. Nat Commun 2013;4:1431</ref>
* Les bactéries peuvent également coloniser des sites que l'on supposait stériles comme le [[derme]] ou l'[[hypoderme]].<ref>Nakatsuji T et al. The microbiome extends to subepidermal compartments of normal skin. Nat Commun 2013;4:1431</ref>
* Les techniques d'identification moléculaire ont révélé une diversité d'espèces plus importante que celles mises en évidence par les techniques classiques.
* Les techniques d'identification moléculaire ont révélé une diversité d'espèces plus importante que celles mises en évidence par les techniques classiques.
==Variation de la composition de la flore cutanée==
==Variation de la composition de la flore cutanée==
===Selon la nature de facteurs physico chimiques===
* Des facteurs liés à l'hôte ou des facteurs environnementaux peuvent provoquer une variation de la composition et de la diversité bactérienne à la surface de la peau.
* Il faut savoir qu'il existe une grande variation inter individuelle: bien que sur chaque zone cutanée le microbiote cutanée soit relativement stable dans le temps chez la même personne, les espèces bactériennes peuvent varier considérablement entre les individus
===Facteurs physico chimiques===
* La composition de la flore varie selon : pH / humidité / température
* La composition de la flore varie selon : pH / humidité / température
* L'humidité permet le dévellopement des bactéries Gram négatif
* L'humidité permet le développement des bactéries Gram négatif
* Les germes résidents peuvent limiter le dévellopement de bactéries plus dangereuses en modifiant l'écologie locale ( variation du pH
* Une exposition aux ultra violet peut modifier par une activité bactéricide la composition du microbiote sur les zones exposées
===En fonction du site anatomique===
===Site anatomique===
* On distingue 3 types de régions cutanées au niveau desquelles des espèces différentes prolifèrent
* On distingue 3 types de régions cutanées au niveau desquelles des espèces différentes prolifèrent
* Flore polymorphe avec prédominance de β-protéobactéries
* Flore polymorphe avec prédominance de β-protéobactéries
===Variation inter individuelles===
===Facteurs environnementaux===
* Le climat, par les variations de température et du degré d'humidité peut modifier le microbiote
===Facteurs liés à l'hôte===
*Des pathologies sous jacentes comme le diabète, une [[dénutrition]], ou l'utilisation d'antibiotiques peuvent modifier le microbiote
* La profession, le port de certains vêtements également
* Bien que sur chaque zone cutanée le microbiote cutanée soit relativement stable dans le temps chez la même personne, les espèces bactériennes peuvent varier considérablement entre les individus
* L'utilisation de savon de composition diverses et de crème émolliente peut également provoquer une variation .
== Rôles du microbiote cutané==
== Rôles du microbiote cutané==
===Intérêts du Microbiote===
* L'interaction hôte-microbiote est bénéfique pour les deux parties . Les germes commensaux ne sont pas pathogène dans des conditions normales (pH , système immunitaire fonctionnel , fonction barrière préservée....)
* Un équilibre s'installe entre flore commensale et flore pathogène. On parle de '''''Symbiose''''' entre la peau et la flore.
* Les modifications de cet équilibre peut provoquer une modification de la composition des bactéries de la peau et/ou une altération du système immunitaire à l'origine de pathologie
===Rôle de défense contre les pathogènes===
* Les commensaux peuvent sécréter des métabolites toxiques pour inhiber la prolifération des pathogènes.<ref>Chiller K , Selkin BA, Murakawa GJ. Skin microflora and bacterial infection of the skin. J Investig Dermatol Symp Proc 2001;6:170-4</ref>
::- Certaines espèces comme S. epidermidis et Corynebacterium spp sont capables d'inhiber la prolifération de S. aureus
::- Certaines souches de S. epidermidis sécrètent une enzyme qui peut inhiber la formation d'un biofilm et la colonisation de S.aureus.
===Maintient de l'intégrité de la barrière épidermique===
* Par un phénomène de saturation, les commensaux vont entrer en compétition pour les nutriments et pour l'espace disponible, limitant ainsi la prolifération des pathogènes.<ref>Relman DA. The human microbiome: ecosystem resilience and health. Nutr Rev 2012, Suppl1:S2-9</ref>
===Maintient du système immunitaire===
==Microbiote cutanée et pathologie==
===Dermatoses inflammatoires===
* Un déséquilibre du microbiote cutané semble être impliqué de plusieurs dermatoses : acné, dermatite atopique, psoriasis, hidradénite suppurée
===[[Plaie chronique|Plaies chroniques]] et microbiote cutané===
* Sur les [[Plaie chronique|plaies chroniques]], les bactéries existent sous forme de bactérie planctoniques (libres) ou sous forme de biofilm.
* Le biofilm est un mode d'organisation et de vie bactérienne très particulier.
* Les études initiales de James ont rapporté que 60% des [[Plaie chronique|plaies chroniques]] étaient colonisées par un biofilm contre 6% seulement pour les plaies aiguës.<ref>James JA, Swogger E, Wolcott R et al. Biofilms in chronic wounds. Wound Rep Reg 2008,16:234-40</ref>
====Composition du biofilm====
* Bactéries d'une ou plusieurs espèces attachées de façon irréversible à une surface
* Englobées dans un matrice de substances extracellulaires polymériques qu'elles fabriquent.
====Organisation du biofilm====
* La formation du biofilm est sous la dépendance de signaux chimiques entre les bactéries permettant sa formation : on parle du '''Quorum sensing'''. Ces signaux permettent
::-la production de la matrice
::-les interactions synergiques ou antagonistes entre les bactéries
::-les changements phénotypiques des bactéries
====Conséquences du biofilm====
* Une des conséquences essentielle est la résistance aux antibiotiques avec des concentrations minimales inhibitrices (CMI) 100 à 1000 fois supérieure à celles des bactéries planctoniques.
* La résistance aux antibiotiques est multifactorielle
::- Présence de la matrice qui serait une barrière physique et/ou chimique à la pénétration des antibiotiques
::- Modulation de l'expression des facteurs de virulences
::- Résistance des bactéries aux défenses immunitaires de l'hôte.
==Références==